深灰市
刚进来会遇到劲敌，他会送伤药让主角前往挑战道馆。
在这里可以学到知识：非自id的宝可梦依然会有经验加成并且受徽章限制控制等级;和巴大蝶一起走的话还可能捡到各种道具。
左上角有个照看呆呆兽的任务，会获得大珍珠(看来这个是每日任务)。
右上角有个要砍树才能进入的屋子，以后利用袈裟斩进入可以和右上角的研究员对话获得“秘密琥珀”，用于复活化石翼龙。
往上来到博物馆，花50元即可进入参观(付款后即使没进入博物馆内就走出门外也算参观过，再次进入还要付费)。
友好商店：这一作有喷雾和香水，喷雾用于让野生宝可梦不再遇到，而香水则会使得稀有宝可梦更容易出现，是常用道具，在这里开始可以进行购买(有钱的话)。
深灰市宝可梦道馆
进入时门卫会要求检查队伍里是否有草属性或者水属性的宝可梦(我抓的是喇叭芽)，如果没有则强制退出门外(这个应该是为皮卡丘版设置的，伊布版学了二连踢可以一路踢完道馆)。打败小刚馆主可以获得灰色徽章，得到招式学习器01“头锤”。
10000光年的梗还在。
获得徽章后走出道馆会遇到青绿(皮卡丘版则是另外一位了)，获得5个超级球。
3号道路
之后往右来到3号道路，一直往右走，入口上方会遇到第一个教练训练家，将其击败会获得活力碎片。
可以捡到伤药+精灵球*3+引虫香水+活力碎片+离洞绳。
下图位置教练训练家对战后可获得招式学习器57“聚宝功”。
宝可梦中心
左上角大叔(真正的火箭队)可以花500买一条鲤鱼王(目前身上唯一水系宝可梦)。
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